Фармацевтическая компания BioNTech и стартап InstaDeep разработали ИИ-систему раннего предупреждения (EWS), которая анализирует данные секвенирования генома SARS-CoV-2 и прогнозирует варианты с высоким риском.
We, together with @instadeepai, have developed an Early Warning System as a new computational method detecting high risk #SARS-CoV-2 variants. In trial period, the system identified >90% of @WHO designated variants 2mths before their official designation. https://t.co/XJgH4LjHLE pic.twitter.com/vAQN2y9lVQ
— BioNTech SE (@BioNTech_Group) January 11, 2022
Новый метод сочетает структурное моделирование вирусного шиповидного белка и алгоритмы искусственного интеллекта. Это позволяет системе быстро помечать потенциальные опасные варианты коронавируса на основе показателей, оценивающих их приспособленность и умение ускользать от иммунного ответа.
Во время испытаний EWS идентифицировала более 90% вариантов за два месяца до того, как их определила ВОЗ. Обозначенные организацией штаммы «альфа», «бета», «гамма», «тета» и «эта» система обнаружила на той же неделе, когда ученые загрузили информацию о них в базу данных. Версию «омикрон» EWS отметила как высокорисковую в тот же день, когда его последовательность стала доступна.
Результаты исследования подчеркивают, что EWS может оценивать новые варианты за считанные минуты и отслеживать их родословные почти в режиме реального времени. Она также способна масштабироваться по мере появления новых данных о мутациях коронавируса.
Соучредитель и генеральный директор InstaDeep Карим Бегир рассказал, что каждую неделю обнаруживается более 10 000 новых последовательностей вариантов, и эксперты-люди не могут справиться со сложными данными в таком масштабе.
«Впервые варианты с высоким риском можно было обнаружить на месте, что потенциально может сэкономить месяцы драгоценного времени», — заявил он.
По словам генерального директора и основателя BioNTech Угура Сахина, раннее выявление потенциально опасных штаммов коронавируса может стать эффективным инструментом для предупреждения исследователей, разработчиков вакцин и органов здравоохранения, предоставляя им больше времени для реагирования.
Напомним, в декабре 2021 года канадский ученый объявил о разработке алгоритма, обнаружившего более 1000 потенциальных методов лечения COVID-19.
В марте британские ученые создали ИИ-инструмент для диагностики коронавируса по звуку кашля.
Источник: Источник
